目前我國細胞培養器皿主要仍使用能反復使用的玻璃器皿，清洗的主要目的是為清除雜質和微生物，使在器皿內部殘留任何影響細胞生長的成分。因此，所使用的玻璃器皿清洗潔凈度顯得尤為重要。
1、新玻璃器皿的清洗
新購置的玻璃器皿含有游離堿較多，是不可以直接使用的。我們需要在2%的鹽酸溶液中浸泡數小時，把表面的堿性中和后，在使用清水反復沖洗。
2、使用過的玻璃器皿的清洗
在微生物檢測實驗中常用的玻璃器皿有：平皿、試管、燒杯、燒瓶等，要先進行高壓滅菌，趁熱倒掉容器中的廢棄物，以溫水沖凈，然后再加5%肥皂水煮沸5min后進行洗刷干凈，再用蒸餾水沖洗干凈。
（1）裝有固體培養基的器皿清洗；事先將器皿上的固體刮去，然后使用清水洗滌，并用試管刷刷其瓶壁，以除去沾污在壁上的灰塵和油垢。使用洗衣粉水洗去油污，然后用水沖洗，洗好后器皿應倒置晾干或置于干燥箱中干燥至無水滴。
（2）盛放一般培養基用的器皿清洗；一般情況下經過洗滌后便可使用，若需要準確配制化學藥品，或做科研用的實驗，要求自來水沖洗干凈后，再用蒸餾水淋洗幾次，晾干或烘干后備用。
（3）染菌的玻璃器皿清洗；需要先經121℃高壓蒸汽滅菌20-30min后取出，趁熱倒出容器內的培養物，再用熱的洗滌劑溶液洗刷干凈，再用清水沖洗。染菌的移液管和毛細吸管，使用后應立即放入5%的石碳酸溶液中浸泡數小時，先滅菌，然后再沖洗。
這些玻璃器皿在經過清洗后，若內壁的水是均勻分布成一薄層，表示油垢清洗干凈；若掛有水珠，則還需要用洗滌液浸泡數小時，然后再用清水充分沖洗。
杜伯特實驗室全自動洗瓶機可以通過預洗、主洗、中和清洗、漂洗、烘干等步驟，運用布朗運動、機械作用、噴淋壓力等原理達到玻璃器皿的全自動高效清潔。相較于人工清洗，實驗室洗瓶機在清洗、干燥、安全性等方面具有諸多優勢：
1、提高工作效率、將動輒半天、一天的清洗時間在45min內完成。
2、節省人工，一臺實驗室洗瓶機基本上可以頂替2-3名專職清洗人員。
3、安全保障，不易損壞器皿，隔絕危險化學藥品和溶劑。有效保護清洗人員安全。
4、潔凈度統一，設備清洗可以設定統一的清洗時間和程序，多批次清洗的器皿潔凈度統一，可追溯和還原過程。
目前，國內實驗室多采用人工清洗，但清洗效果、清洗效率、清洗驗證等方面均沒有得到更好的體現。建議對器皿潔凈度要求較高的實驗室，使用實驗室洗瓶機進行標準化、自動化清洗。
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